Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms