Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COG6Q9Y2V7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms