Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZRN3Q9UPQ7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms