Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TPCN1Q9ULQ1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TPCN1Q9ULQ1 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms