Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKIRAS2Q9NYR9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKIRAS2Q9NYR9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms