Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CLN6Q9NWW5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms