Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB6BQ9NRW1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB6BQ9NRW1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms