Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ARFGAP3Q9NP61 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms