Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 CLEC4C-201ENST00000354629 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
SENP3Q9H4L4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 GEMIN2-202ENST00000308317 1420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 CYTOR-202ENST00000409054 1096 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 LMLN-AS1-201ENST00000423460 542 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 SUZ12P1-207ENST00000583950 741 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC023050.4-201ENST00000538830 1380 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AL807752.1-201ENST00000395082 1322 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC025252.1-201ENST00000535247 556 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC027013.1-201ENST00000554412 1057 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 ZNF365-211ENST00000614806 877 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SENP3Q9H4L4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms