Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC90BQ9GZT6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms