Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDGFDQ9GZP0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PDGFDQ9GZP0 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms