Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYB0

SHANK3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK3Q9BYB0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SHANK3Q9BYB0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHANK3Q9BYB0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms