Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF559Q9BR84 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms