Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALS2CR12Q96Q35 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ALS2CR12Q96Q35 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms