Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
COG3Q96JB2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COG3Q96JB2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms