Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PIK3C3Q8NEB9 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PIK3C3Q8NEB9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms