Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC74

RBBP8NL, RBBP8 N-terminal-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8NLQ8NC74 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RBBP8NLQ8NC74 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RBBP8NLQ8NC74 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms