Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CHCHD4Q8N4Q1 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
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