Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
USP43Q70EL4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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