Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TREML4Q6UXN2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TREML4Q6UXN2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms