Protein–RNA interactions for Protein: Q658K8

EEF1DP3, Putative elongation factor 1-delta-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1DP3Q658K8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEF1DP3Q658K8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEF1DP3Q658K8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEF1DP3Q658K8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
EEF1DP3Q658K8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEF1DP3Q658K8 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEF1DP3Q658K8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEF1DP3Q658K8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EEF1DP3Q658K8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EEF1DP3Q658K8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EEF1DP3Q658K8 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EEF1DP3Q658K8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EEF1DP3Q658K8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EEF1DP3Q658K8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EEF1DP3Q658K8 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EEF1DP3Q658K8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EEF1DP3Q658K8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EEF1DP3Q658K8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EEF1DP3Q658K8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EEF1DP3Q658K8 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms