Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GPAT3Q53EU6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPAT3Q53EU6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPAT3Q53EU6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPAT3Q53EU6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
GPAT3Q53EU6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms