Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 RSF1-IT1-201ENST00000528233 632 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 AL023284.3-202ENST00000571188 543 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 AL049536.1-201ENST00000625043 744 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FOXD1Q16676 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 AC010487.2-201ENST00000594546 486 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 ABI1-206ENST00000376140 1446 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 FCAR-203ENST00000355524 1483 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
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FOXD1Q16676 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
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FOXD1Q16676 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 AC104123.1-203ENST00000513158 575 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 KCTD14-202ENST00000533144 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 KCNIP4-204ENST00000382150 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXD1Q16676 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
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