Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
VPS72Q15906 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS72Q15906 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
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