Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP6AP1Q15904 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms