Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NME3Q13232 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME3Q13232 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME3Q13232 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME3Q13232 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME3Q13232 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME3Q13232 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME3Q13232 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME3Q13232 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME3Q13232 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME3Q13232 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME3Q13232 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME3Q13232 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NME3Q13232 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME3Q13232 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME3Q13232 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME3Q13232 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME3Q13232 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME3Q13232 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME3Q13232 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME3Q13232 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME3Q13232 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME3Q13232 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME3Q13232 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME3Q13232 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME3Q13232 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME3Q13232 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NME3Q13232 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME3Q13232 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME3Q13232 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME3Q13232 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NME3Q13232 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NME3Q13232 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NME3Q13232 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
NME3Q13232 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NME3Q13232 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NME3Q13232 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NME3Q13232 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NME3Q13232 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NME3Q13232 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NME3Q13232 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NME3Q13232 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NME3Q13232 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NME3Q13232 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NME3Q13232 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NME3Q13232 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NME3Q13232 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NME3Q13232 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NME3Q13232 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NME3Q13232 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NME3Q13232 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NME3Q13232 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NME3Q13232 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NME3Q13232 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NME3Q13232 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
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