Protein–RNA interactions for Protein: Q13206

DDX10, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX10Q13206 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDX10Q13206 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms