Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PTP4A2Q12974 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms