Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
COX10Q12887 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
COX10Q12887 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COX10Q12887 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COX10Q12887 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COX10Q12887 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COX10Q12887 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
COX10Q12887 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
COX10Q12887 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms