Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL9Q07325 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CXCL9Q07325 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms