Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PRKCDQ05655 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PRKCDQ05655 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms