Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CYP4A11Q02928 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms