Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TOP2BQ02880 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TOP2BQ02880 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms