Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SKOR1P84550 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms