Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KLF3P57682 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KLF3P57682 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KLF3P57682 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms