Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NESP48681 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
NESP48681 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
NESP48681 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NESP48681 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NESP48681 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
NESP48681 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NESP48681 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
NESP48681 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NESP48681 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NESP48681 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
NESP48681 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NESP48681 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NESP48681 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NESP48681 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NESP48681 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
NESP48681 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NESP48681 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NESP48681 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NESP48681 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
NESP48681 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NESP48681 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
NESP48681 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
NESP48681 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NESP48681 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NESP48681 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NESP48681 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
NESP48681 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NESP48681 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NESP48681 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NESP48681 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
NESP48681 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NESP48681 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NESP48681 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NESP48681 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NESP48681 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NESP48681 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NESP48681 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NESP48681 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NESP48681 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
NESP48681 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NESP48681 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NESP48681 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NESP48681 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NESP48681 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
NESP48681 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
NESP48681 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NESP48681 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
NESP48681 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NESP48681 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NESP48681 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NESP48681 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
NESP48681 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NESP48681 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NESP48681 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NESP48681 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NESP48681 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
NESP48681 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NESP48681 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NESP48681 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NESP48681 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
NESP48681 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NESP48681 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
NESP48681 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NESP48681 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
NESP48681 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NESP48681 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NESP48681 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NESP48681 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NESP48681 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NESP48681 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NESP48681 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NESP48681 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NESP48681 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
NESP48681 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
NESP48681 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
NESP48681 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NESP48681 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
NESP48681 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NESP48681 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
NESP48681 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NESP48681 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NESP48681 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NESP48681 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
NESP48681 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NESP48681 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
NESP48681 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NESP48681 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
NESP48681 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
NESP48681 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NESP48681 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NESP48681 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
NESP48681 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NESP48681 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
NESP48681 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NESP48681 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NESP48681 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NESP48681 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NESP48681 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
NESP48681 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms