Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP2P42575 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP2P42575 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP2P42575 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP2P42575 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP2P42575 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP2P42575 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP2P42575 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP2P42575 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP2P42575 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP2P42575 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP2P42575 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP2P42575 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP2P42575 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP2P42575 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP2P42575 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP2P42575 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP2P42575 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CASP2P42575 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CASP2P42575 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP2P42575 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP2P42575 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP2P42575 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP2P42575 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP2P42575 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP2P42575 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP2P42575 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP2P42575 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP2P42575 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
CASP2P42575 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP2P42575 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP2P42575 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP2P42575 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP2P42575 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP2P42575 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP2P42575 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP2P42575 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP2P42575 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP2P42575 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP2P42575 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP2P42575 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP2P42575 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP2P42575 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP2P42575 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP2P42575 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP2P42575 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP2P42575 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP2P42575 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP2P42575 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP2P42575 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP2P42575 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP2P42575 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP2P42575 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP2P42575 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CASP2P42575 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP2P42575 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP2P42575 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP2P42575 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP2P42575 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP2P42575 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP2P42575 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP2P42575 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP2P42575 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP2P42575 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP2P42575 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP2P42575 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP2P42575 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP2P42575 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms