Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC1P35052 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GPC1P35052 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPC1P35052 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPC1P35052 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPC1P35052 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPC1P35052 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPC1P35052 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPC1P35052 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPC1P35052 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPC1P35052 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPC1P35052 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPC1P35052 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPC1P35052 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPC1P35052 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPC1P35052 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPC1P35052 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPC1P35052 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPC1P35052 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPC1P35052 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPC1P35052 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPC1P35052 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPC1P35052 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPC1P35052 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPC1P35052 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPC1P35052 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GPC1P35052 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPC1P35052 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GPC1P35052 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms