Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX2P28328 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX2P28328 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX2P28328 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX2P28328 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX2P28328 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX2P28328 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX2P28328 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX2P28328 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX2P28328 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX2P28328 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX2P28328 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX2P28328 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PEX2P28328 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PEX2P28328 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX2P28328 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX2P28328 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX2P28328 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX2P28328 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX2P28328 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX2P28328 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX2P28328 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX2P28328 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX2P28328 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX2P28328 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX2P28328 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX2P28328 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX2P28328 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX2P28328 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX2P28328 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX2P28328 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX2P28328 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX2P28328 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX2P28328 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX2P28328 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX2P28328 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX2P28328 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX2P28328 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX2P28328 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX2P28328 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PEX2P28328 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PEX2P28328 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms