Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PSMA4P25789 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PSMA4P25789 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms