Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APCP25054 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
APCP25054 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APCP25054 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APCP25054 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APCP25054 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APCP25054 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
APCP25054 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APCP25054 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APCP25054 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APCP25054 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APCP25054 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APCP25054 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APCP25054 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APCP25054 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
APCP25054 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APCP25054 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APCP25054 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APCP25054 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APCP25054 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APCP25054 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APCP25054 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APCP25054 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
APCP25054 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APCP25054 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APCP25054 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
APCP25054 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
APCP25054 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
APCP25054 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
APCP25054 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
APCP25054 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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