Protein–RNA interactions for Protein: P0DI81

TRAPPC2, Trafficking protein particle complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2P0DI81 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2P0DI81 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2P0DI81 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2P0DI81 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2P0DI81 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2P0DI81 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2P0DI81 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2P0DI81 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2P0DI81 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2P0DI81 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2P0DI81 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2P0DI81 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2P0DI81 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2P0DI81 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2P0DI81 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2P0DI81 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2P0DI81 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2P0DI81 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2P0DI81 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2P0DI81 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2P0DI81 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2P0DI81 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2P0DI81 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2P0DI81 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2P0DI81 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2P0DI81 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2P0DI81 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2P0DI81 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRAPPC2P0DI81 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms