Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GLI1P08151 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GLI1P08151 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GLI1P08151 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GLI1P08151 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
GLI1P08151 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
GLI1P08151 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI1P08151 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI1P08151 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI1P08151 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI1P08151 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI1P08151 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI1P08151 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI1P08151 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI1P08151 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI1P08151 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI1P08151 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI1P08151 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI1P08151 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI1P08151 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI1P08151 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI1P08151 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI1P08151 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
GLI1P08151 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GLI1P08151 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GLI1P08151 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GLI1P08151 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GLI1P08151 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GLI1P08151 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GLI1P08151 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GLI1P08151 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GLI1P08151 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms