Protein–RNA interactions for Protein: O94972

TRIM37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM37O94972 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM37O94972 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms