Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIOO75962 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIOO75962 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIOO75962 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIOO75962 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIOO75962 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIOO75962 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIOO75962 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIOO75962 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIOO75962 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIOO75962 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIOO75962 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIOO75962 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIOO75962 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIOO75962 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIOO75962 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIOO75962 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIOO75962 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIOO75962 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIOO75962 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIOO75962 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIOO75962 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIOO75962 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIOO75962 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIOO75962 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIOO75962 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIOO75962 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIOO75962 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIOO75962 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRIOO75962 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIOO75962 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIOO75962 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIOO75962 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIOO75962 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIOO75962 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIOO75962 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIOO75962 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIOO75962 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIOO75962 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIOO75962 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIOO75962 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIOO75962 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIOO75962 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIOO75962 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIOO75962 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIOO75962 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIOO75962 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIOO75962 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIOO75962 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIOO75962 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIOO75962 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRIOO75962 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIOO75962 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIOO75962 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIOO75962 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIOO75962 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIOO75962 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIOO75962 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIOO75962 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRIOO75962 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRIOO75962 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TRIOO75962 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIOO75962 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIOO75962 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIOO75962 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRIOO75962 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TRIOO75962 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms