Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
EIF3JO75822 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms