Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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MTSS1O43312 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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MTSS1O43312 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MTSS1O43312 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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