Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRODHO43272 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRODHO43272 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRODHO43272 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRODHO43272 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRODHO43272 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRODHO43272 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRODHO43272 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRODHO43272 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRODHO43272 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRODHO43272 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRODHO43272 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRODHO43272 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRODHO43272 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRODHO43272 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PRODHO43272 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PRODHO43272 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRODHO43272 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRODHO43272 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PRODHO43272 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRODHO43272 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRODHO43272 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRODHO43272 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRODHO43272 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRODHO43272 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRODHO43272 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRODHO43272 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRODHO43272 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRODHO43272 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRODHO43272 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRODHO43272 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRODHO43272 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRODHO43272 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRODHO43272 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PRODHO43272 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRODHO43272 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRODHO43272 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRODHO43272 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRODHO43272 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRODHO43272 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRODHO43272 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRODHO43272 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRODHO43272 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRODHO43272 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRODHO43272 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRODHO43272 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRODHO43272 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PRODHO43272 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRODHO43272 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRODHO43272 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRODHO43272 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRODHO43272 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRODHO43272 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRODHO43272 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRODHO43272 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRODHO43272 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRODHO43272 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRODHO43272 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRODHO43272 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRODHO43272 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRODHO43272 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRODHO43272 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRODHO43272 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PRODHO43272 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PRODHO43272 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms