Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ZNF879B4DU55 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF879B4DU55 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms