Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ARID3CA6NKF2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARID3CA6NKF2 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms